Uważa się, że fajka wodna jest mniej szkodliwa niż cygaro, jednak najnowsze badania wskazują inaczej.

Uzależnienie od nikotyny stanowi powszechny problem społeczny, często bagatelizowany ze względu na swoją akceptowalność. Tradycyjne wyroby tytoniowe zawierają szereg związków chemicznych, które systematycznie degradują organizm, znacząco podnosząc ryzyko wystąpienia nowotworów – przede wszystkim w obrębie układu oddechowego oraz górnych dróg oddechowych. W poszukiwaniu mniej szkodliwej alternatywy, niektórzy decydują się na korzystanie z fajek wodnych, zakładając błędnie, iż proces filtracji przez wodę eliminuje większość toksyn. Badania przeprowadzone przez specjalistów z Uniwersytetu Pittsburskiego dowodzą jednak, że podczas pojedynczej sesji z użyciem shishy użytkownik narażony jest na wdychanie aż 125-krotnie większej objętości dymu, 25-krotnie wyższe stężenie substancji smolistych, 2,5-krotnie większą dawkę nikotyny oraz 10-krotnie podwyższony poziom tlenku węgla w porównaniu do palaczy papierosów. Przyczyną tak drastycznych różnic jest przedłużony czas trwania sesji, podczas której organizm absorbuje ilość szkodliwych związków porównywalną do spożycia pełnej paczki wyrobów tytoniowych. Alternatywy takie jak e-papierosy również nie stanowią bezpiecznego rozwiązania – ich płyny zawierają substancje potencjalnie rakotwórcze, a długoterminowe skutki ich stosowania pozostają wciąż niewystarczająco zbadane.